Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 FAM228B-210ENST00000615575 1357 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 AC005562.1-201ENST00000583030 3219 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 NLRX1-204ENST00000409991 3716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 MEAF6-203ENST00000373074 2005 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 CAMK2A-203ENST00000398376 1493 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 NDRG4-221ENST00000563799 3014 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 SPHK2-201ENST00000245222 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 PLEKHB2-205ENST00000409279 2488 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 CAP2-209ENST00000616440 2776 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 TCAF2-202ENST00000411935 2906 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 AGAP10P-201ENST00000454844 2418 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 SAFB-211ENST00000592224 3014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 AC051649.2-201ENST00000640310 3319 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 MAGI3-202ENST00000369611 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 AL356258.1-201ENST00000605929 2246 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 NIPA1-201ENST00000337435 6567 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 AC011498.7-201ENST00000624986 2027 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 GNAQ-201ENST00000286548 6539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 MARK1-201ENST00000366917 2946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 ZFP28-204ENST00000591844 3475 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 RBBP8NL-201ENST00000252998 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 CASP8-202ENST00000264275 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 CCDC57-203ENST00000392343 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
LMBRD1Q9NUN5 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms