Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 FBXL4-201ENST00000229971 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 C16orf92-201ENST00000300575 895 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC15.02■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC15.02■□□□□ -0
SNX15Q9NRS6 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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SNX15Q9NRS6 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 COL6A2-201ENST00000300527 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
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SNX15Q9NRS6 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 LINC01285-201ENST00000412422 2289 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 AC092506.1-201ENST00000634580 2275 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 MPZL1-203ENST00000392121 3421 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.01□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 CCNDBP1-201ENST00000300213 3660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 DRC3-203ENST00000399187 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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SNX15Q9NRS6 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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SNX15Q9NRS6 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 UNC13B-201ENST00000378495 6303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 SLC25A21-AS1-201ENST00000556667 1924 ntBASIC15□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 CLEC16A-202ENST00000409552 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 ZFP36L1-201ENST00000336440 3026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
SNX15Q9NRS6 VDAC1P7-201ENST00000462417 847 ntBASIC15□□□□□ -0.01
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