Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0I3

CCSER1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCSER1Q9C0I3 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 C12orf10-201ENST00000267103 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 AL512384.1-201ENST00000406683 331 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 VPS18-202ENST00000558474 873 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 AC008750.3-201ENST00000601148 437 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 AL591163.1-201ENST00000641757 987 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 HTR3A-205ENST00000504030 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 STAM-202ENST00000377524 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 AC092135.3-201ENST00000624151 1846 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 INE2-201ENST00000630399 1874 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 CLIC5-208ENST00000544153 2051 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 FKBP6-201ENST00000252037 1500 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
CCSER1Q9C0I3 CTCFL-210ENST00000481655 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
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