Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 COX5BP8-201ENST00000416911 349 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 ZNF586-205ENST00000598885 578 ntTSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 GOLIM4-202ENST00000470487 4373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 SLC12A7-201ENST00000264930 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 KBTBD4-202ENST00000430070 2372 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 TAGLN2-202ENST00000368096 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 CRLF2-203ENST00000400841 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 KNDC1-201ENST00000304613 6793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 ARID3B-201ENST00000346246 4271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 SFXN3-202ENST00000393459 3098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 RIMS1-214ENST00000518273 4116 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 LRRFIP1-204ENST00000392000 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 TFCP2-201ENST00000257915 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 AL353597.1-201ENST00000414875 998 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 TMEM117-207ENST00000551577 2643 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 ATP6V0A4-201ENST00000310018 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 CYP4F24P-201ENST00000586049 1580 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
TRIM55Q9BYV6 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48 ms