Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY10

SLC46A2, Thymic stromal cotransporter homolog, humanhuman

Predictions only

Length 475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC46A2Q9BY10 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 SIGLEC6-202ENST00000346477 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 ARHGAP45-212ENST00000590577 3218 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 PDE9A-208ENST00000398225 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 AC006335.1-201ENST00000445200 547 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 IFITM1-204ENST00000528780 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 PHF8-203ENST00000338946 4651 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 FOXO4-201ENST00000341558 1353 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 MVK-214ENST00000629016 1591 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 HDAC11-214ENST00000446613 2875 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 RSPO1-202ENST00000401068 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 AL035414.1-201ENST00000451327 857 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 AC105362.1-201ENST00000511234 564 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 AC016044.1-201ENST00000560818 572 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 AC103988.2-201ENST00000561804 725 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 A1BG-AS1-204ENST00000595302 2130 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 NAP1L6-202ENST00000641404 1222 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 NCOA1-205ENST00000406961 7289 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SLC46A2Q9BY10 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms