Protein–RNA interactions for Protein: Q9BVL2

NUP58, Nucleoporin p58/p45, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP58Q9BVL2 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 FAM107A-206ENST00000474531 2271 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 ALDOA-209ENST00000563060 1550 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 SELENON-203ENST00000374315 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 SLC26A11-201ENST00000361193 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 AGPS-201ENST00000264167 7764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 PRAMEF25-202ENST00000619661 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 TSFM-207ENST00000540550 1935 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 PDE3B-202ENST00000455098 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 KMT2E-201ENST00000257745 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
NUP58Q9BVL2 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms