Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
C9orf16Q9BUW7 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
C9orf16Q9BUW7 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
C9orf16Q9BUW7 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
C9orf16Q9BUW7 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
C9orf16Q9BUW7 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC14.1□□□□□ -0.15
C9orf16Q9BUW7 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
C9orf16Q9BUW7 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC14.1□□□□□ -0.15
C9orf16Q9BUW7 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
C9orf16Q9BUW7 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
C9orf16Q9BUW7 PPP1R1B-208ENST00000580825 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
C9orf16Q9BUW7 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
C9orf16Q9BUW7 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
C9orf16Q9BUW7 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
C9orf16Q9BUW7 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
C9orf16Q9BUW7 RCAN2-203ENST00000371374 3327 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
C9orf16Q9BUW7 ESPN-201ENST00000377828 3531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
C9orf16Q9BUW7 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
C9orf16Q9BUW7 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
C9orf16Q9BUW7 TMEM200A-204ENST00000617887 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
C9orf16Q9BUW7 CAMK2B-217ENST00000457475 4142 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
C9orf16Q9BUW7 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
C9orf16Q9BUW7 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
C9orf16Q9BUW7 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC14.1□□□□□ -0.15
C9orf16Q9BUW7 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.15
C9orf16Q9BUW7 SLC9B1-201ENST00000296422 1879 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
C9orf16Q9BUW7 ADAT1-201ENST00000307921 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
C9orf16Q9BUW7 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
C9orf16Q9BUW7 PNRC2-201ENST00000334351 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
C9orf16Q9BUW7 UACA-201ENST00000322954 6939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
C9orf16Q9BUW7 MAP2K7-203ENST00000397983 3396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C9orf16Q9BUW7 IL20RA-207ENST00000541547 3382 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
C9orf16Q9BUW7 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C9orf16Q9BUW7 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
C9orf16Q9BUW7 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
C9orf16Q9BUW7 AL731571.1-201ENST00000617058 5428 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
C9orf16Q9BUW7 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C9orf16Q9BUW7 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C9orf16Q9BUW7 HSD17B4-215ENST00000510025 2589 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
C9orf16Q9BUW7 AP1B1-208ENST00000432560 4146 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
C9orf16Q9BUW7 GRIP2-204ENST00000619221 7977 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
C9orf16Q9BUW7 AC011899.2-202ENST00000438047 4302 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C9orf16Q9BUW7 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C9orf16Q9BUW7 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C9orf16Q9BUW7 GPT2-201ENST00000340124 3984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C9orf16Q9BUW7 SATB2-211ENST00000614512 4972 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
C9orf16Q9BUW7 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
C9orf16Q9BUW7 ISY1-203ENST00000393295 3842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C9orf16Q9BUW7 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C9orf16Q9BUW7 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
C9orf16Q9BUW7 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
C9orf16Q9BUW7 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
C9orf16Q9BUW7 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C9orf16Q9BUW7 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
C9orf16Q9BUW7 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
C9orf16Q9BUW7 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
C9orf16Q9BUW7 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
C9orf16Q9BUW7 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C9orf16Q9BUW7 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC14.09□□□□□ -0.15
C9orf16Q9BUW7 SSBP1-215ENST00000612337 884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.09□□□□□ -0.15
C9orf16Q9BUW7 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
C9orf16Q9BUW7 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.09□□□□□ -0.15
C9orf16Q9BUW7 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C9orf16Q9BUW7 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC14.09□□□□□ -0.15
C9orf16Q9BUW7 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C9orf16Q9BUW7 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C9orf16Q9BUW7 RIBC2-202ENST00000614167 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C9orf16Q9BUW7 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C9orf16Q9BUW7 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C9orf16Q9BUW7 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
C9orf16Q9BUW7 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C9orf16Q9BUW7 RIN3-201ENST00000216487 3859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C9orf16Q9BUW7 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
C9orf16Q9BUW7 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C9orf16Q9BUW7 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C9orf16Q9BUW7 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.09□□□□□ -0.15
C9orf16Q9BUW7 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C9orf16Q9BUW7 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C9orf16Q9BUW7 TRIM13-202ENST00000378182 7249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C9orf16Q9BUW7 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C9orf16Q9BUW7 PPP6R2-204ENST00000395744 3293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.09□□□□□ -0.15
C9orf16Q9BUW7 ZNF800-203ENST00000393313 4358 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
C9orf16Q9BUW7 AC015802.6-201ENST00000640006 5654 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
C9orf16Q9BUW7 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
C9orf16Q9BUW7 ELAC2-201ENST00000338034 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
C9orf16Q9BUW7 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
C9orf16Q9BUW7 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.15
C9orf16Q9BUW7 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.15
C9orf16Q9BUW7 SPACA9-203ENST00000372136 2536 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.15
C9orf16Q9BUW7 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 TGFBRAP1-201ENST00000258449 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC14.08□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 AC020658.7-201ENST00000624274 2442 ntBASIC14.08□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 PCMTD1-201ENST00000360540 4252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.08□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
C9orf16Q9BUW7 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.08□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms