Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRZ2

TRIM56, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM56, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 755 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM56Q9BRZ2 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 AC008443.3-201ENST00000412295 549 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 ADRB2-201ENST00000305988 3443 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 MTRF1L-202ENST00000367231 3539 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 ATP6V0E1-203ENST00000519374 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 LHX6-207ENST00000541397 2942 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 CEP131-208ENST00000575907 3444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 FTH1-201ENST00000273550 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 AC147067.1-201ENST00000466692 579 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 FTH1-202ENST00000526640 786 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRIM56Q9BRZ2 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms