Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI5

SGIP1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGIP1Q9BQI5 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 KRT18P4-201ENST00000422599 1288 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 AL121987.1-201ENST00000435580 645 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 GTF2I-203ENST00000443166 979 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 RN7SL767P-201ENST00000493013 295 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 MIR2278-201ENST00000516344 96 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 LAMTOR1-208ENST00000545249 965 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 AC079174.1-201ENST00000552486 312 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 HNRNPA1P5-201ENST00000558213 966 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 ANKRD36C-208ENST00000619511 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 OAZ3-207ENST00000627780 850 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 OAZ3-209ENST00000635322 745 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 CADPS2-201ENST00000313070 6065 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 ARMC8-213ENST00000470821 1656 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 SKOR2-201ENST00000400404 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 LRRC3-AS1-201ENST00000426578 784 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 GSS-202ENST00000451957 1092 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 FOXP4-AS1-205ENST00000454812 575 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 TMEM14B-208ENST00000467317 1224 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 AC011431.1-201ENST00000512971 230 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 AAMDC-210ENST00000532481 690 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 TNFSF13B-206ENST00000542136 495 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 LOXL1-AS1-207ENST00000565689 735 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 ANKRD26P1-203ENST00000569528 966 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 AC011451.1-201ENST00000591336 405 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 AC254633.1-201ENST00000606790 345 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 EZH2-202ENST00000350995 2477 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 DSCAM-AS1-202ENST00000427451 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 CST9-201ENST00000376971 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 MSANTD2P1-201ENST00000445341 1368 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SGIP1Q9BQI5 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 GALP-201ENST00000357330 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 AP000354.1-201ENST00000396982 456 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 GALP-202ENST00000440823 889 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 LINC02274-201ENST00000555539 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 DIO3OS-211ENST00000557532 712 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 AC120498.7-201ENST00000562876 330 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 LINC02252-201ENST00000565706 487 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 USP32P3-202ENST00000583574 611 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 MCM8-AS1-201ENST00000613522 983 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 AC020922.4-201ENST00000621389 339 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 SLC3A2-204ENST00000377891 2222 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SGIP1Q9BQI5 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms