Protein–RNA interactions for Protein: Q96P20

NLRP3, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,036 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP3Q96P20 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 SZRD1-203ENST00000471507 892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 NEU3-205ENST00000531619 582 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 NR2F2-AS1-215ENST00000620029 1223 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 TRPV4-204ENST00000536838 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 CD48-203ENST00000613788 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 RPS9-201ENST00000302907 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 CALCA-203ENST00000396372 581 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 FBXO24-204ENST00000465843 957 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 UPK1B-205ENST00000497685 981 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 GOSR2-203ENST00000415811 2171 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 TMEM65-201ENST00000297632 9029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 SLC20A1-201ENST00000272542 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 RHD-202ENST00000342055 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 CITED1-202ENST00000373619 886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NLRP3Q96P20 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.3 ms