Protein–RNA interactions for Protein: Q96M83

CCDC7, Coiled-coil domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 1,385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC7Q96M83 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC7Q96M83 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC7Q96M83 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC7Q96M83 RNA5SP423-201ENST00000517127 109 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC7Q96M83 COX14-203ENST00000550487 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC7Q96M83 GLIS2-AS1-201ENST00000576080 340 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC7Q96M83 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC7Q96M83 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC7Q96M83 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC7Q96M83 PRKN-211ENST00000615065 261 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC7Q96M83 FAM219A-206ENST00000379087 3573 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC7Q96M83 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC7Q96M83 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC7Q96M83 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC7Q96M83 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC7Q96M83 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC7Q96M83 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC7Q96M83 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC7Q96M83 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC7Q96M83 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC7Q96M83 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC7Q96M83 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC7Q96M83 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC7Q96M83 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC7Q96M83 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC7Q96M83 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC7Q96M83 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC7Q96M83 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC7Q96M83 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC7Q96M83 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC7Q96M83 FCGR1B-203ENST00000369384 1044 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC7Q96M83 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC7Q96M83 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC7Q96M83 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC7Q96M83 TUBB8-202ENST00000562809 820 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC7Q96M83 AP005329.1-201ENST00000578800 1035 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC7Q96M83 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC7Q96M83 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
CCDC7Q96M83 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC7Q96M83 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC7Q96M83 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC7Q96M83 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC7Q96M83 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC7Q96M83 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC7Q96M83 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC7Q96M83 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC7Q96M83 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC7Q96M83 RAF1-205ENST00000442415 3085 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC7Q96M83 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC7Q96M83 TRMT11-201ENST00000334379 1565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC7Q96M83 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC7Q96M83 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC7Q96M83 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC7Q96M83 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC7Q96M83 MYH14-204ENST00000440075 4247 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC7Q96M83 CSH1-201ENST00000316193 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC7Q96M83 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC7Q96M83 VAMP1-203ENST00000400911 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC7Q96M83 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC7Q96M83 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC7Q96M83 PFN2-215ENST00000497148 743 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC7Q96M83 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC7Q96M83 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC7Q96M83 AP001258.2-201ENST00000529891 490 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC7Q96M83 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC7Q96M83 UBXN1-218ENST00000616865 1002 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC7Q96M83 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
CCDC7Q96M83 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC7Q96M83 SALL4P5-201ENST00000419001 1760 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC7Q96M83 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC7Q96M83 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC7Q96M83 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC7Q96M83 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC7Q96M83 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC7Q96M83 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC7Q96M83 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC7Q96M83 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC7Q96M83 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC7Q96M83 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
CCDC7Q96M83 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 ZFP41-203ENST00000520584 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 OSTF1-201ENST00000346234 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
CCDC7Q96M83 WDR45-224ENST00000485908 1301 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms