Protein–RNA interactions for Protein: Q96L96

ALPK3, Alpha-protein kinase 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPK3Q96L96 HIST1H2BF-201ENST00000356530 1196 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 FOXP4-AS1-202ENST00000432751 409 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 TNFRSF12A-204ENST00000573001 648 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 AC003006.1-202ENST00000594684 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 AL133467.4-201ENST00000602953 725 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 AL353622.2-201ENST00000605846 425 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 AC080013.5-201ENST00000607044 679 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 GNG14-201ENST00000640117 210 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 TMEM176B-204ENST00000447204 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 OXSM-201ENST00000280701 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 SMYD1-203ENST00000444564 1816 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 RPL3L-201ENST00000268661 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 NQO2-204ENST00000380454 851 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 PPP1R7-205ENST00000404405 1009 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 AC006329.1-201ENST00000419422 705 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 KLF17P1-201ENST00000547105 1126 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 TRAPPC2L-212ENST00000567312 499 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 SHANK2-202ENST00000357171 1373 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 MBD1-225ENST00000591535 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 SERF1B-204ENST00000506542 1666 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 FAU-201ENST00000279259 461 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 ACTG2-204ENST00000409918 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 HIST1H2APS2-201ENST00000454426 370 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 AC009163.5-202ENST00000571737 466 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 ANKRD20A21P-201ENST00000611282 517 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 ANXA8L1-206ENST00000619162 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 PCK2-208ENST00000559250 1804 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 ETNPPL-206ENST00000510706 1692 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 COQ4-201ENST00000300452 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 NHP2P1-201ENST00000335274 462 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 Z95624.1-201ENST00000413528 628 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 MRPL43-211ENST00000477279 903 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 EIF5A2-205ENST00000487522 565 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 GPX3-202ENST00000517973 612 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 AF111169.3-201ENST00000553991 756 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 ANKRD26P1-203ENST00000569528 966 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 SCGB1B2P-201ENST00000595013 612 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
ALPK3Q96L96 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms