Protein–RNA interactions for Protein: Q96DC8

ECHDC3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHDC3Q96DC8 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ECHDC3Q96DC8 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ECHDC3Q96DC8 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ECHDC3Q96DC8 SHROOM1-201ENST00000319854 3190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ECHDC3Q96DC8 DCUN1D4-203ENST00000451288 4269 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
ECHDC3Q96DC8 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ECHDC3Q96DC8 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ECHDC3Q96DC8 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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ECHDC3Q96DC8 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ECHDC3Q96DC8 LINC01667-202ENST00000623919 1422 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
ECHDC3Q96DC8 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ECHDC3Q96DC8 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
ECHDC3Q96DC8 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
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ECHDC3Q96DC8 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
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ECHDC3Q96DC8 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
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ECHDC3Q96DC8 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC14.99□□□□□ -0.01
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ECHDC3Q96DC8 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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ECHDC3Q96DC8 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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ECHDC3Q96DC8 OCEL1-213ENST00000601529 942 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
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ECHDC3Q96DC8 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ECHDC3Q96DC8 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ECHDC3Q96DC8 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ECHDC3Q96DC8 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ECHDC3Q96DC8 DBET-201ENST00000630918 3363 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
ECHDC3Q96DC8 RNF157-AS1-204ENST00000590137 1812 ntTSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ECHDC3Q96DC8 ANKS6-202ENST00000375019 2586 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
ECHDC3Q96DC8 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ECHDC3Q96DC8 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ECHDC3Q96DC8 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ECHDC3Q96DC8 DEPDC7-201ENST00000241051 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ECHDC3Q96DC8 CLCN7-202ENST00000382745 4720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ECHDC3Q96DC8 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ECHDC3Q96DC8 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
ECHDC3Q96DC8 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
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