Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 SBF1-202ENST00000380817 8008 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 ATP2A3-202ENST00000352011 3274 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 HTR7-203ENST00000371719 3033 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 ARMC5-205ENST00000563544 3549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 PRRT2-202ENST00000358758 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 PPP1R13L-202ENST00000418234 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 GPR37-201ENST00000303921 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 EIF4G1-218ENST00000434061 5026 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 CNKSR2-203ENST00000425654 5668 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 RSPH9-202ENST00000372165 2586 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 SYNRG-225ENST00000619541 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 SPATS2L-209ENST00000409988 2698 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 ARVCF-203ENST00000406259 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 LINC01301-205ENST00000531654 1347 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 TRIM41-201ENST00000315073 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 ARHGAP4-203ENST00000370028 3372 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 TRA2B-202ENST00000342294 288 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 AC040162.1-202ENST00000573493 573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 TRIM46-202ENST00000368382 3127 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 ZNF354B-201ENST00000322434 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 HSD17B4-222ENST00000515320 2494 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 ABCG1-201ENST00000343687 3037 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SMARCE1Q969G3 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms