Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 DAAM2-211ENST00000633794 3871 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 FAU-201ENST00000279259 461 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 RN7SL173P-201ENST00000461853 292 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 ADM-203ENST00000525063 867 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 FOXN3-AS2-201ENST00000554071 1262 ntBASIC12.86□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 CDIPT-AS1-202ENST00000565014 729 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC12.86□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC12.86□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC12.86□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 MYBPHL-201ENST00000357155 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.86□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 PPP1R7-205ENST00000404405 1009 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 MIR1301-201ENST00000408518 82 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 ACTG1P19-201ENST00000418987 1116 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 DNM1P48-201ENST00000419538 439 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 GNAT1-202ENST00000433068 1224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 AL162377.1-202ENST00000456688 1181 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 CISD2-202ENST00000503643 808 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 AC113391.2-201ENST00000512245 553 ntTSL 4 BASIC12.85□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 AC006547.3-201ENST00000600090 583 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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USP9XQ93008 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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USP9XQ93008 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 WASH7P-201ENST00000488147 1351 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
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USP9XQ93008 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 ODF3L1-201ENST00000332145 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 PRELID3B-202ENST00000371033 943 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 AC002127.2-201ENST00000444032 792 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 KLF3-AS1-203ENST00000504219 627 ntTSL 3 BASIC12.85□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 ANAPC15-204ENST00000535234 848 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 GOLGA2P7-209ENST00000560408 745 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 AL590235.1-201ENST00000564650 861 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
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USP9XQ93008 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC12.85□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 MIR3936HG-204ENST00000621103 1793 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 BAX-201ENST00000293288 1358 ntTSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.85□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 RBFOX3-203ENST00000580155 1519 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.85□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 AHCYP4-201ENST00000419201 1315 ntBASIC12.85□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 TREM2-202ENST00000373113 1044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 FRMD4A-204ENST00000475141 1233 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 RPL18AP8-201ENST00000486071 528 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC12.84□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 LINC01485-202ENST00000520324 566 ntTSL 4 BASIC12.84□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 PGPEP1-206ENST00000597431 545 ntTSL 5 BASIC12.84□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.84□□□□□ -0.35
USP9XQ93008 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC12.84□□□□□ -0.35
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