Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVD3

RNF138, E3 ubiquitin-protein ligase RNF138, humanhuman

Predictions only

Length 245 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF138Q8WVD3 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 B9D1-209ENST00000477478 1353 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 CSRP1-201ENST00000340006 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 ATL3-203ENST00000538786 1920 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 SRP14-201ENST00000267884 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 PAX4-201ENST00000338516 1085 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 AC004471.1-201ENST00000456035 582 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 AC084859.1-201ENST00000533002 670 ntTSL 4 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 AC008537.4-201ENST00000595728 1103 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 IGHV1OR21-1-201ENST00000622028 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 SYNE2-228ENST00000639659 1290 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 SLC2A11-203ENST00000345044 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 DNAI1-209ENST00000614641 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 ABCB8-221ENST00000498578 2350 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 TBRG4-215ENST00000494076 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 CD68-202ENST00000380498 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 ATP6V1C1-202ENST00000518738 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 CXCL12-201ENST00000343575 1857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 LINC00327-203ENST00000576696 1308 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 ZNF576-203ENST00000525771 2327 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 RPS3-201ENST00000278572 907 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 CALCA-201ENST00000331587 843 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 NDUFAB1P1-201ENST00000404262 460 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 AC012574.2-201ENST00000520375 443 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 AC007376.2-201ENST00000556271 540 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 LINC02332-201ENST00000557232 386 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 AC005730.2-201ENST00000564549 1184 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 AC007861.2-201ENST00000573819 571 ntTSL 4 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 FP565260.5-201ENST00000623188 479 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 AC006453.2-202ENST00000635968 827 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
RNF138Q8WVD3 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.2 ms