Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6F1

CLDN19, Claudin-19, humanhuman

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19Q8N6F1 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN19Q8N6F1 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN19Q8N6F1 AL353747.3-201ENST00000454185 579 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN19Q8N6F1 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN19Q8N6F1 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN19Q8N6F1 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN19Q8N6F1 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN19Q8N6F1 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN19Q8N6F1 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN19Q8N6F1 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN19Q8N6F1 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN19Q8N6F1 LRP8-202ENST00000347547 2382 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN19Q8N6F1 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN19Q8N6F1 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN19Q8N6F1 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN19Q8N6F1 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN19Q8N6F1 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN19Q8N6F1 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN19Q8N6F1 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN19Q8N6F1 ARFIP1-202ENST00000356064 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN19Q8N6F1 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN19Q8N6F1 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN19Q8N6F1 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
CLDN19Q8N6F1 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN19Q8N6F1 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN19Q8N6F1 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN19Q8N6F1 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN19Q8N6F1 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN19Q8N6F1 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN19Q8N6F1 FGR-203ENST00000374005 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN19Q8N6F1 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN19Q8N6F1 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN19Q8N6F1 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CLDN19Q8N6F1 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN19Q8N6F1 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN19Q8N6F1 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN19Q8N6F1 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CLDN19Q8N6F1 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN19Q8N6F1 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CLDN19Q8N6F1 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN19Q8N6F1 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CLDN19Q8N6F1 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CLDN19Q8N6F1 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN19Q8N6F1 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CLDN19Q8N6F1 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CLDN19Q8N6F1 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN19Q8N6F1 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
CLDN19Q8N6F1 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CLDN19Q8N6F1 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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CLDN19Q8N6F1 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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CLDN19Q8N6F1 USP47-207ENST00000527733 4525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 SAFB-202ENST00000454510 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 OVOL1-AS1-202ENST00000532454 494 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 AC025279.2-201ENST00000569730 653 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 GPR137C-201ENST00000321662 3888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
CLDN19Q8N6F1 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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