Protein–RNA interactions for Protein: Q8N488

RYBP, RING1 and YY1-binding protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RYBPQ8N488 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 KIAA1217-203ENST00000376452 6052 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 USP36-201ENST00000312010 5234 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 ZNF618-201ENST00000288466 9109 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 MOXD1-202ENST00000367963 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 STEAP2-202ENST00000394621 7033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 DISC1-222ENST00000622252 6927 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 CERS6-202ENST00000392687 6851 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 FOXB1-201ENST00000396057 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 AL132711.1-201ENST00000557546 722 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 SCGB1C2-201ENST00000595228 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 NFIC-206ENST00000589123 8068 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 UBE3A-220ENST00000630424 5075 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 RNF25-201ENST00000295704 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RYBPQ8N488 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms