Protein–RNA interactions for Protein: Q8N129

CNPY4, Protein canopy homolog 4, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNPY4Q8N129 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 ACSM2B-201ENST00000329697 2935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 SWAP70-201ENST00000318950 4882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 DCST2-202ENST00000368424 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 ZNF7-218ENST00000544249 2125 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 GRIPAP1-215ENST00000622599 2881 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 TMEM270-201ENST00000320531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 PCDHB17P-202ENST00000623466 3066 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 DYNC1LI1-201ENST00000273130 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 PTPRU-205ENST00000460170 5337 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 CD300LB-202ENST00000392621 2286 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 GPR68-204ENST00000535815 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 C7orf57-202ENST00000420324 1957 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 DSTN-201ENST00000246069 3617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 CLCNKA-202ENST00000375692 2581 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 KIF7-201ENST00000394412 4551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 TPM3P9-201ENST00000424846 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 EIF3L-214ENST00000624234 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 AC040169.1-201ENST00000565382 521 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 ATG16L1-202ENST00000373525 2767 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 LINC01257-201ENST00000376678 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 SNAP29-201ENST00000215730 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 RARG-203ENST00000425354 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 ARSH-201ENST00000381130 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 ZNF778-202ENST00000433976 3608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 WIPI1-201ENST00000262139 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 MAEL-201ENST00000367870 1831 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 CNDP2-201ENST00000324262 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 CYP2AB1P-202ENST00000454440 1456 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CNPY4Q8N129 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms