Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXF0

NPAS3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3Q8IXF0 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 CENPK-202ENST00000396679 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 PIGC-201ENST00000344529 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 FAM45A-201ENST00000361432 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 ARFIP1-204ENST00000429148 1599 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 NAF1-201ENST00000274054 1907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 FADS2-212ENST00000522639 360 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 NR2C2AP-207ENST00000544883 899 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 AC242376.1-201ENST00000559033 726 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 FADS2-215ENST00000574708 385 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 AC011825.3-201ENST00000583184 565 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 NCR1-206ENST00000598576 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 AC006453.1-201ENST00000636037 1257 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 TFPI2-201ENST00000222543 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 VRK3-207ENST00000594092 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 CRHR2-202ENST00000348438 1600 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 CELA3B-201ENST00000337107 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 AC073150.1-201ENST00000450406 1084 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 AL139412.1-202ENST00000452465 675 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NPAS3Q8IXF0 EEF1D-218ENST00000526838 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms