Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 DTX3L-201ENST00000296161 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 NUP210-201ENST00000254508 7193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 CYB5R2-204ENST00000524790 1338 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 NDUFB8-202ENST00000370320 684 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 TAGLN-202ENST00000392951 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 TMEM247-204ENST00000434431 680 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 BCRP3-202ENST00000621462 1021 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 AL033527.5-201ENST00000641382 801 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 KIRREL1-204ENST00000368173 7519 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 DCUN1D4-202ENST00000381441 4207 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 ATP8B3-201ENST00000310127 5095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 PCDHGB1-202ENST00000611598 2592 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 ABCA7-202ENST00000433129 6704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 KRT8P22-201ENST00000562317 1415 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 MEIOC-201ENST00000409122 4604 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
PLD3Q8IV08 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PLD3Q8IV08 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PLD3Q8IV08 SOCS2P1-201ENST00000417727 557 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PLD3Q8IV08 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PLD3Q8IV08 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PLD3Q8IV08 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PLD3Q8IV08 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PLD3Q8IV08 POLE2-203ENST00000553805 496 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PLD3Q8IV08 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PLD3Q8IV08 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PLD3Q8IV08 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PLD3Q8IV08 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PLD3Q8IV08 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PLD3Q8IV08 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PLD3Q8IV08 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PLD3Q8IV08 CU634019.7-201ENST00000624153 1185 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PLD3Q8IV08 FP236241.2-201ENST00000624906 1185 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
PLD3Q8IV08 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PLD3Q8IV08 CFLAR-206ENST00000395148 4415 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PLD3Q8IV08 ALOX12B-201ENST00000319144 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PLD3Q8IV08 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PLD3Q8IV08 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PLD3Q8IV08 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PLD3Q8IV08 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PLD3Q8IV08 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PLD3Q8IV08 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PLD3Q8IV08 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PLD3Q8IV08 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PLD3Q8IV08 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
PLD3Q8IV08 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PLD3Q8IV08 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
PLD3Q8IV08 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms