Protein–RNA interactions for Protein: Q86TL0

ATG4D, Cysteine protease ATG4D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4DQ86TL0 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 INHBA-203ENST00000442711 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 PQLC2L-201ENST00000312275 1201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 TPM3-208ENST00000341485 2063 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 TOMM34-201ENST00000372813 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 CATSPER4-202ENST00000456354 1912 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 CPLX2-202ENST00000393745 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 AC243836.1-201ENST00000416696 438 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 ATP5G2P4-201ENST00000442175 420 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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ATG4DQ86TL0 LCN10-206ENST00000527229 615 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
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ATG4DQ86TL0 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 B4GALT3-213ENST00000622395 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 OXTR-201ENST00000316793 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
ATG4DQ86TL0 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
ATG4DQ86TL0 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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