Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXI7

VIT, Vitrin, humanhuman

Predictions only

Length 678 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VITQ6UXI7 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 AC009884.2-201ENST00000603110 324 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 C4A-243ENST00000428956 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 C4B-202ENST00000435363 5460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 PLAG1-203ENST00000429357 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 CYB561D1-201ENST00000310611 5009 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 AL391361.3-201ENST00000420601 379 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 NAT9-211ENST00000580632 799 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 ATP2C1-224ENST00000533801 3690 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 ALOX15B-204ENST00000572022 2396 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 TSPO2-201ENST00000373158 718 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
VITQ6UXI7 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms