Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW7

NANOGP8, Putative homeobox protein NANOGP8, humanhuman

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NANOGP8Q6NSW7 GTF2IRD1-202ENST00000424337 3077 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 TIGD1-201ENST00000408957 2625 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 STRA6-205ENST00000432245 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 PPT1-213ENST00000641319 2388 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 OIP5-AS1-209ENST00000561226 775 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 CYP20A1-201ENST00000356079 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 KCNC2-202ENST00000350228 3344 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 NTRK3-AS1-201ENST00000569588 2663 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 RAD17-207ENST00000361732 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 NAA60-202ENST00000407558 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 RTEL1-203ENST00000360203 4623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 TPCN1-214ENST00000550785 5345 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 PRPF3-201ENST00000324862 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 CIAPIN1-213ENST00000569370 1559 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 BOLL-203ENST00000392296 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 ADD1-204ENST00000398123 2361 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 ITGB2-208ENST00000397857 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 FRMD8-202ENST00000355991 3514 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
NANOGP8Q6NSW7 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.1 ms