Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ5

LRRC8E, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8E, humanhuman

Predictions only

Length 796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8EQ6NSJ5 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF559-202ENST00000393883 5095 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 SYNRG-217ENST00000612223 8229 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 TBC1D2-203ENST00000375064 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 RBAKDN-201ENST00000498308 514 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 AC233702.7-201ENST00000536958 924 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 GPX4-206ENST00000588919 803 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 SLC44A2-201ENST00000335757 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 H6PD-203ENST00000602477 5590 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 GGA1-206ENST00000406772 3205 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
LRRC8EQ6NSJ5 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms