Protein–RNA interactions for Protein: Q6ICC9

RTL6, Retrotransposon Gag-like protein 6, humanhuman

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Length 239 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTL6Q6ICC9 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 HAUS3-204ENST00000506763 3166 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 MUC1-202ENST00000338684 1107 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 RAB4B-201ENST00000357052 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 AL355994.3-201ENST00000437156 466 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 MUC1-218ENST00000471283 635 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 CCDC153-204ENST00000503566 1295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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RTL6Q6ICC9 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
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RTL6Q6ICC9 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
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RTL6Q6ICC9 HBP1-201ENST00000222574 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 FANCA-213ENST00000563673 1694 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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RTL6Q6ICC9 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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RTL6Q6ICC9 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
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RTL6Q6ICC9 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 MAP3K8-201ENST00000263056 3096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 AP000350.4-201ENST00000433835 788 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 AL591846.1-201ENST00000451736 433 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 SMAD2-202ENST00000356825 10445 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 ANKRD33-202ENST00000340970 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 ARF6-201ENST00000298316 3865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 TBC1D8B-203ENST00000357242 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
RTL6Q6ICC9 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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