Protein–RNA interactions for Protein: Q68J44

DUPD1, Dual specificity phosphatase DUPD1, humanhuman

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUPD1Q68J44 PKIG-203ENST00000372887 769 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 AL161757.4-201ENST00000554149 621 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 SDC1-201ENST00000254351 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 DDX41-208ENST00000507955 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 BAIAP2-201ENST00000321280 1939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 STAG3L2-201ENST00000426587 2130 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 CPSF7-201ENST00000340437 3695 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 AC055854.1-203ENST00000521141 1630 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 CYP1B1-AS1-201ENST00000413828 1781 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 CCNG1-202ENST00000393929 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 DDX20-201ENST00000369702 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 AC005899.8-201ENST00000625127 3153 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 CELF1-214ENST00000531165 3650 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 FGFR1-201ENST00000326324 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 FGFR1-204ENST00000356207 3824 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 KCNQ1DN-201ENST00000441418 1093 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 MLF1-201ENST00000355893 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 CHRD-206ENST00000450923 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 ILK-201ENST00000299421 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 CES1-203ENST00000422046 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 PROM2-203ENST00000403131 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 HNRNPR-204ENST00000427764 1788 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 AC012184.2-203ENST00000443119 2110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 PRSS16-203ENST00000421826 1949 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 OSBPL8-203ENST00000393250 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
DUPD1Q68J44 AL355390.1-201ENST00000325811 2328 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.5 ms