Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWN6

FAM208B, Protein FAM208B, humanhuman

Predictions only

Length 2,430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM208BQ5VWN6 GLIS3-AS1-201ENST00000451340 734 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 PILRA-205ENST00000453419 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 YWHAE-212ENST00000575977 540 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 PPY-202ENST00000587006 431 ntTSL 3 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 AP001462.1-201ENST00000594089 452 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 AC027601.3-201ENST00000622907 509 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 CCDC32-215ENST00000625629 801 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 ZDHHC6-201ENST00000369404 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 UCN3-201ENST00000380433 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 MIR193A-201ENST00000384882 88 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 AP001057.1-201ENST00000437557 799 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 AC139887.2-201ENST00000503571 531 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 CRYBB2P1-204ENST00000509460 701 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 SLC25A3-215ENST00000551265 580 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 LINC01490-202ENST00000551399 1260 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 GSTZ1-210ENST00000554279 795 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 BMF-206ENST00000558774 671 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 MIR4459-201ENST00000581837 66 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 AC092327.2-201ENST00000595705 901 ntTSL 3 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 AL135936.1-201ENST00000617956 998 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 AC245369.7-201ENST00000631386 350 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 B3GLCT-201ENST00000343307 4254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 AC106785.2-201ENST00000564385 1319 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 RAB23-202ENST00000468148 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 GSS-202ENST00000451957 1092 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 IP6K2-223ENST00000453202 571 ntTSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 RAMP3-203ENST00000496212 543 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 FAM49B-223ENST00000522746 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 C15orf62-201ENST00000344320 2370 ntAPPRIS P1 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 TBC1D8-202ENST00000409318 3803 ntTSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 AL627095.1-201ENST00000414775 321 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 LINC00303-203ENST00000427799 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 PLA2G6-210ENST00000435484 612 ntTSL 4 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 AC106047.1-202ENST00000467484 482 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 SNRPD2P2-201ENST00000473818 333 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 AC007292.1-201ENST00000594444 746 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 AL590556.2-202ENST00000636906 844 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
FAM208BQ5VWN6 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms