Protein–RNA interactions for Protein: Q53S08

RAB6C, Rab6C, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB6CQ53S08 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 GOLGA8R-201ENST00000327271 1896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 CLCNKA-201ENST00000331433 2475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 VARS2-201ENST00000321897 4073 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 AL138725.1-201ENST00000407347 1314 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 ZNF79-202ENST00000543471 2194 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 ZNF79-203ENST00000612342 2192 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 TARS2-203ENST00000369054 1998 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 PRNP-201ENST00000379440 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 C4B-AS1-205ENST00000415626 2095 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 C4A-AS1-204ENST00000458633 2095 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 PPP1R1B-205ENST00000579000 1466 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 ORC6-206ENST00000568364 888 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 ZNF790-AS1-204ENST00000589556 650 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 ZC3HAV1-204ENST00000471652 3182 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 SDHAF2-201ENST00000301761 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 FAM103A1-201ENST00000304191 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 CDC37-201ENST00000222005 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 PDHX-201ENST00000227868 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 KIF19-202ENST00000389916 3643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 RABL2B-202ENST00000395590 2380 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 CCDC68-204ENST00000591504 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 MBNL1-201ENST00000282486 6422 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 SVIL-AS1-208ENST00000446807 1007 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
RAB6CQ53S08 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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