Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 DRG2-202ENST00000395726 1897 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 TNXB-203ENST00000451343 3125 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 TCHH-202ENST00000614923 6995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 NLRP10-201ENST00000328600 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 COL2A1-201ENST00000337299 4257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 FAM214B-201ENST00000322813 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 OLFML2B-201ENST00000294794 3160 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 PCDHGC3-202ENST00000611950 2849 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 UBP1-204ENST00000447368 3669 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 ITIH1-211ENST00000537050 2493 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 AC125611.4-201ENST00000553259 4166 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 CLEC12A-AS1-201ENST00000420905 3956 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 PPP1R26P1-201ENST00000474415 3613 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 AFF3-201ENST00000317233 8135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 C3AR1-201ENST00000307637 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 ACSM2B-202ENST00000414188 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 LMOD3-202ENST00000475434 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 ELN-204ENST00000357036 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 KDM3A-216ENST00000542128 4311 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 MAPK4-206ENST00000592595 4330 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 CCT3-211ENST00000472765 1858 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 AC138470.1-201ENST00000624638 1897 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 INPP5J-201ENST00000331075 3347 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 ZSCAN31-201ENST00000344279 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 DCAF10-202ENST00000377724 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 EFCAB11-208ENST00000555872 2716 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 COLQ-203ENST00000383788 3005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 STXBP1-201ENST00000373299 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 ADCY4-201ENST00000310677 3415 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 ADAMTS10-211ENST00000597188 3749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 C3orf49-201ENST00000295896 1292 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 BPNT1-201ENST00000322067 2465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 AAAS-202ENST00000394384 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 ARHGAP25-202ENST00000409202 2945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 CDKN2B-AS1-203ENST00000428597 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
ANKRD39Q53RE8 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC10.88□□□□□ -0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms