Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 ARSE-206ENST00000545496 2506 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
GEN1Q17RS7 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 NIN-202ENST00000324330 4364 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 IKZF1-205ENST00000357364 5925 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 NRAS-201ENST00000369535 4449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 MLKL-201ENST00000306247 1781 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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GEN1Q17RS7 TRMT112-201ENST00000308774 561 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 MASP2-202ENST00000400898 726 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 MTMR9-201ENST00000221086 7481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 KIF21B-201ENST00000332129 9897 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
GEN1Q17RS7 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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