Protein–RNA interactions for Protein: Q16795

NDUFA9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 9, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFA9Q16795 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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NDUFA9Q16795 UPK1A-204ENST00000617999 1268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
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NDUFA9Q16795 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 RGPD5-202ENST00000272454 2907 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
NDUFA9Q16795 GPR17-201ENST00000272644 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
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NDUFA9Q16795 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
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NDUFA9Q16795 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
NDUFA9Q16795 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
NDUFA9Q16795 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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NDUFA9Q16795 SPTLC2-201ENST00000216484 8170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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NDUFA9Q16795 MFSD14B-201ENST00000375344 3420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.1
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NDUFA9Q16795 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.1
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NDUFA9Q16795 HGNC:24955-201ENST00000303177 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NDUFA9Q16795 MPPE1-201ENST00000309976 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NDUFA9Q16795 ASPH-202ENST00000379449 1603 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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NDUFA9Q16795 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
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NDUFA9Q16795 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NDUFA9Q16795 PIP5K1A-202ENST00000368888 2134 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NDUFA9Q16795 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NDUFA9Q16795 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NDUFA9Q16795 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.44□□□□□ -0.1
NDUFA9Q16795 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
NDUFA9Q16795 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.44□□□□□ -0.1
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