Protein–RNA interactions for Protein: Q16586

SGCA, Alpha-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCAQ16586 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 COL22A1-201ENST00000303045 6346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 AC015712.6-201ENST00000431060 5068 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 ZFYVE28-211ENST00000515312 3247 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 AC018755.2-201ENST00000599649 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 ABCC6-208ENST00000622290 4941 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 PI4K2A-201ENST00000370631 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 LONP1-202ENST00000540670 3002 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 TICRR-202ENST00000560985 6656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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SGCAQ16586 RPS6KC1-207ENST00000543470 4227 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 SLC12A5-211ENST00000616933 6166 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 SLAIN1-216ENST00000488699 1461 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 LINC00987-201ENST00000427111 2472 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 NOL9-201ENST00000377705 6649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 AC138969.2-201ENST00000532739 9932 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 RP1L1-202ENST00000382483 7973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 THEMIS2-203ENST00000373925 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
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SGCAQ16586 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 SRC-202ENST00000373558 4304 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
SGCAQ16586 FAM219A-201ENST00000297620 3588 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 FGD5-AS1-202ENST00000424349 3792 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 AC134915.1-201ENST00000426461 574 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 WDR53-203ENST00000429115 683 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 AC021491.2-201ENST00000513017 607 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 AC138466.1-201ENST00000535242 391 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
SGCAQ16586 AC005785.1-202ENST00000597164 237 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
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