Protein–RNA interactions for Protein: Q16533

SNAPC1, snRNA-activating protein complex subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC1Q16533 POU6F1-208ENST00000550824 2664 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 TRIM65-201ENST00000269383 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 ALDH3A2-226ENST00000631291 3822 ntTSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 CSF2RB-202ENST00000403662 4863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC13.81□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 TMPRSS2-202ENST00000398585 3240 ntTSL 2 BASIC13.81□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 PRKCB-201ENST00000303531 7969 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.81□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 ORMDL3-202ENST00000394169 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 ZNF570-201ENST00000330173 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 CGB7-203ENST00000597853 3386 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 KCNT1-212ENST00000628528 7057 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 BLOC1S6-212ENST00000566753 1996 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 STX18-AS1-207ENST00000610009 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 CNOT3-201ENST00000221232 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 AKIP1-204ENST00000396648 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 PUS1-205ENST00000535067 838 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 ANK1-205ENST00000347528 8237 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 CPXM2-201ENST00000241305 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 PLIN4-201ENST00000301286 6353 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 PDRG1-201ENST00000202017 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 ARHGAP45-202ENST00000539243 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 POFUT1-202ENST00000375749 5235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 VPS26B-201ENST00000281187 3691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 TCEAL4-209ENST00000472745 1571 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 CFAP46-202ENST00000368586 8278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 MCM9-202ENST00000316316 5101 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 AL359881.3-201ENST00000602640 1721 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 IL17RD-203ENST00000463523 2348 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 EPHB3-201ENST00000330394 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 GRM1-203ENST00000361719 6754 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 EPHB4-210ENST00000616502 3737 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
SNAPC1Q16533 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms