Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

Predictions only

Length 980 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 OR1J1-201ENST00000259357 969 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 COMMD4-201ENST00000267935 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 MAP2K3-201ENST00000316920 1246 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 COMMD4-202ENST00000338995 722 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 ANO1-AS2-202ENST00000533327 498 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 COMMD4-211ENST00000564815 639 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 AL109837.1-201ENST00000603272 613 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 AL031665.1-201ENST00000619766 572 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 FOSB-213ENST00000615753 1468 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 MAGEA1-201ENST00000356661 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 UBA6-202ENST00000420827 1664 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 FGFR3P1-201ENST00000449999 601 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 EFCAB10-201ENST00000460135 717 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 PGAP2-224ENST00000490830 810 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 TALDO1-203ENST00000528097 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 ANP32A-210ENST00000560303 724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 WDR7-208ENST00000589935 544 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 GK2-201ENST00000358842 1942 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 MEGF10-206ENST00000508365 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
GRIK5Q16478 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms