Protein–RNA interactions for Protein: Q16204

CCDC6, Coiled-coil domain-containing protein 6, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC6Q16204 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 UMODL1-206ENST00000408989 5262 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 OXA1L-203ENST00000412791 1440 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 GPAT2-202ENST00000434632 3061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 MROH2A-201ENST00000389758 5355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 PLXNB2-207ENST00000449103 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 AC018685.1-201ENST00000457813 368 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 RPL13AP20-201ENST00000459725 609 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 RIT1-205ENST00000539040 919 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 Z84492.1-201ENST00000606589 408 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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CCDC6Q16204 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 STK40-201ENST00000359297 4837 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 ZNF783-202ENST00000434415 4452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 LIPE-AS1-205ENST00000594688 2383 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 ACP2-201ENST00000256997 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 NTNG1-208ENST00000370074 3048 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 UBE3A-224ENST00000635914 9352 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 NME4-207ENST00000450036 985 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 AC078852.2-201ENST00000504748 527 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 AC012322.1-201ENST00000561657 861 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 PPA1-206ENST00000625364 644 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 KCNT1-209ENST00000490355 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CCDC6Q16204 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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