Protein–RNA interactions for Protein: Q15906

VPS72, Vacuolar protein sorting-associated protein 72 homolog, humanhuman

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Length 364 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPS72Q15906 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 AC106827.1-201ENST00000366454 431 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 CHCHD2P2-201ENST00000503744 321 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 AC092612.1-201ENST00000514501 998 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 NAA40-205ENST00000539656 577 ntTSL 4 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 KNOP1P1-201ENST00000542108 989 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 AC125603.3-201ENST00000550742 486 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 AC017033.1-201ENST00000603720 708 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 AC129778.1-201ENST00000623957 920 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 HTR3E-203ENST00000425359 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 SLCO5A1-206ENST00000530307 2630 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 ADGRG2-210ENST00000379878 4803 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 AP003680.1-201ENST00000598970 3660 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 MRPS10-201ENST00000053468 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 BTNL8-203ENST00000400707 1512 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 MRPL33-201ENST00000296102 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 MRPL33-202ENST00000379666 404 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 RANGRF-202ENST00000407006 1074 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 HTATIP2-202ENST00000421577 886 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 C11orf97-201ENST00000542198 701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 LINC01154-201ENST00000548617 454 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 PLA2G15-209ENST00000566188 1203 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 COX5A-205ENST00000568517 582 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 ZNF286A-212ENST00000580259 527 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 KRT17P4-206ENST00000584151 719 ntTSL 4 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 CICP13-201ENST00000422015 2789 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 UBOX5-AS1-201ENST00000446537 1792 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 EIF4E2-205ENST00000409394 604 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 DDX39B-AS1-208ENST00000420520 516 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 AC128689.1-202ENST00000459861 827 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 IGKV1D-43-201ENST00000468879 532 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 RN7SL288P-201ENST00000490496 291 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 NUDCD2-202ENST00000517501 448 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 PMEL-214ENST00000550447 901 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 KRT8P2-201ENST00000556193 944 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 LINC01002-234ENST00000633808 848 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 NIT1-204ENST00000392190 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 C12orf76-209ENST00000615315 1580 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
VPS72Q15906 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
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