Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 CC2D1B-201ENST00000284376 3377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 CCDC117-202ENST00000421503 3766 ntTSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 DHRS4-AS1-204ENST00000555045 1848 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 BPI-201ENST00000262865 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 RGS9-210ENST00000635833 2308 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 GID4-201ENST00000268719 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 PCK2-216ENST00000561286 2012 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 VPS52-212ENST00000445902 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 SELPLG-202ENST00000388962 1613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 LRRC8D-201ENST00000337338 3950 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 PNPLA6-202ENST00000414982 4522 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 ALOX15B-201ENST00000380173 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 DACH1-204ENST00000620444 4627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 MRPL3P1-201ENST00000400109 1033 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 METTL13-203ENST00000367737 2865 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 RTF1-201ENST00000389629 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 MOCS3-201ENST00000244051 5106 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 FADS2-201ENST00000257261 2964 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 ACSL1-208ENST00000507295 2490 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 PTPRO-201ENST00000281171 5301 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 ATG9A-204ENST00000409422 2512 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 CARD10-203ENST00000406271 3127 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 ATG13-215ENST00000529655 2566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 SMG8-201ENST00000300917 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 MROH1-209ENST00000534366 5092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 ZBED1-203ENST00000381223 4510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 TMEM104-201ENST00000335464 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 API5-203ENST00000455725 2257 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 CTD-2194D22.4-201ENST00000514569 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 DENND1C-202ENST00000543576 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 CHFR-205ENST00000450056 3250 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 PCDHB3-201ENST00000231130 3355 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 FBXO21-202ENST00000427718 4138 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 RPL13P2-201ENST00000440687 659 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 PSEN2-202ENST00000366783 2306 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
ATP6AP1Q15904 AC083964.2-201ENST00000623988 2396 ntBASIC14.04□□□□□ -0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms