Protein–RNA interactions for Protein: Q15788

NCOA1, Nuclear receptor coactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA1Q15788 BUD31-205ENST00000456893 512 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCOA1Q15788 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCOA1Q15788 HTATIP2-205ENST00000530266 713 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCOA1Q15788 EIF5AP2-201ENST00000585668 1047 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NCOA1Q15788 HPN-206ENST00000597419 1212 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCOA1Q15788 IRF3-225ENST00000600022 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCOA1Q15788 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NCOA1Q15788 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCOA1Q15788 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCOA1Q15788 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NCOA1Q15788 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCOA1Q15788 LINC01165-201ENST00000445190 1623 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
NCOA1Q15788 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCOA1Q15788 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCOA1Q15788 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
NCOA1Q15788 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCOA1Q15788 F10-203ENST00000409306 1450 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCOA1Q15788 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCOA1Q15788 ENC1-201ENST00000302351 5520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCOA1Q15788 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCOA1Q15788 MRPL37P1-201ENST00000592451 1337 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NCOA1Q15788 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCOA1Q15788 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCOA1Q15788 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCOA1Q15788 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCOA1Q15788 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCOA1Q15788 MC1R-202ENST00000555147 3099 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCOA1Q15788 AC211486.1-201ENST00000275590 980 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCOA1Q15788 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCOA1Q15788 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCOA1Q15788 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCOA1Q15788 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCOA1Q15788 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCOA1Q15788 OR2R1P-201ENST00000441404 914 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NCOA1Q15788 LINC00322-201ENST00000450205 699 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCOA1Q15788 AC108199.1-201ENST00000504249 508 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCOA1Q15788 EIF1AD-211ENST00000533544 965 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCOA1Q15788 MRPL49-209ENST00000534078 518 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCOA1Q15788 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCOA1Q15788 JMJD8-203ENST00000562824 1015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCOA1Q15788 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCOA1Q15788 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCOA1Q15788 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
NCOA1Q15788 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCOA1Q15788 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCOA1Q15788 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCOA1Q15788 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCOA1Q15788 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCOA1Q15788 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
NCOA1Q15788 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCOA1Q15788 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCOA1Q15788 KCTD1-207ENST00000580059 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCOA1Q15788 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCOA1Q15788 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCOA1Q15788 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCOA1Q15788 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCOA1Q15788 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCOA1Q15788 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCOA1Q15788 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCOA1Q15788 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
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NCOA1Q15788 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
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NCOA1Q15788 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
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NCOA1Q15788 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
NCOA1Q15788 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
NCOA1Q15788 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
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NCOA1Q15788 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
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NCOA1Q15788 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NCOA1Q15788 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
NCOA1Q15788 SCGN-203ENST00000612225 1402 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
NCOA1Q15788 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCOA1Q15788 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCOA1Q15788 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCOA1Q15788 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCOA1Q15788 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCOA1Q15788 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCOA1Q15788 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCOA1Q15788 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCOA1Q15788 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NCOA1Q15788 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCOA1Q15788 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCOA1Q15788 C3orf38-204ENST00000486971 1259 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCOA1Q15788 EMP2-203ENST00000536829 781 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCOA1Q15788 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
NCOA1Q15788 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCOA1Q15788 AC018761.2-201ENST00000585496 296 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCOA1Q15788 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCOA1Q15788 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCOA1Q15788 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCOA1Q15788 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
NCOA1Q15788 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
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