Protein–RNA interactions for Protein: Q15543

TAF13, Transcription initiation factor TFIID subunit 13, humanhuman

Predictions only

Length 124 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF13Q15543 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 RERG-209ENST00000546331 1383 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 E2F7-201ENST00000322886 5740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 ADGRG6-202ENST00000296932 6849 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 LTBP3-221ENST00000532932 3327 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 DUOXA1-210ENST00000559014 1965 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 TLL2-201ENST00000357947 6756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 TONSL-201ENST00000409379 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 LGR5-201ENST00000266674 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 APOA1-AS-201ENST00000444200 563 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 SMARCA4-204ENST00000444061 4938 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 CACNA1G-232ENST00000515411 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 TMPRSS3-204ENST00000433957 2403 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 ITPR2-202ENST00000381340 11405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 ADAM12-202ENST00000368679 7938 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 RTN4-202ENST00000337526 4790 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 MAD2L1-201ENST00000296509 5468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC13.52□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 TCAIM-201ENST00000342649 3687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 CCNJ-201ENST00000265992 4115 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 OSBPL1A-201ENST00000319481 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 ANAPC5-201ENST00000261819 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 NR3C2-209ENST00000625323 5909 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 USP51-201ENST00000500968 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
TAF13Q15543 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms