Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 OR2C3-201ENST00000366487 8467 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 ZNF575-202ENST00000458714 2285 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 ATP6V1H-202ENST00000359530 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 PITPNM2-201ENST00000280562 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 LINC01759-201ENST00000412639 985 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 Metazoa_SRP.80-201ENST00000619894 320 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 COX11-210ENST00000639671 696 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 GLIS2-201ENST00000262366 4469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 LINC01250-201ENST00000457478 2344 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 CNPY1-203ENST00000636372 2259 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 FGF6-201ENST00000228837 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 LBX2-201ENST00000341396 886 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 LNCPRESS1-201ENST00000429254 756 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
RAB35Q15286 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 89.3 ms