Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 PML-201ENST00000268058 4508 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 CDKN2AIP-201ENST00000302350 2646 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 PPIL2-212ENST00000626352 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 LINC00839-202ENST00000429940 2253 ntTSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 DHX36-213ENST00000496811 6733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC13□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 WDR25-204ENST00000554175 2055 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 NOX3-201ENST00000159060 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 PLAGL1-201ENST00000354765 3663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 ACP5-202ENST00000412435 1527 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 C19orf57-201ENST00000346736 2489 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 VASH1-203ENST00000554237 1462 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 MAGIX-208ENST00000616266 3295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 TOMM22P5-201ENST00000416399 439 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 BMP7-AS1-201ENST00000445956 436 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 TP53TG3HP-202ENST00000569755 579 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 ALDH3B1-203ENST00000612297 1231 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 CHRNA7-201ENST00000306901 6181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 MAP3K11-208ENST00000530153 2830 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 BCAR1-202ENST00000393420 2667 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 GPRC5C-202ENST00000392627 2988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 HNRNPLL-205ENST00000409636 3980 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 ANKLE1-201ENST00000394458 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 TDH-201ENST00000525246 1357 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 GAS2L1-209ENST00000618518 3382 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 LINC01116-202ENST00000339037 838 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
PDCD1Q15116 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
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