Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 RPS6KA4-201ENST00000334205 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 ADAM15-202ENST00000355956 2877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 OSBPL3-201ENST00000313367 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 TTLL4-212ENST00000457313 3723 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 PCDHGA3-203ENST00000619750 2695 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 OR2V1-202ENST00000641318 2665 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 PRDM15-201ENST00000269844 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 AC008507.2-201ENST00000588402 1176 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 TMEM179-205ENST00000615704 636 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 HDAC11-213ENST00000437379 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 AC020915.4-201ENST00000597230 2708 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 PHLDA1-201ENST00000266671 8069 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 INTS11-204ENST00000421495 1868 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 TPO-205ENST00000382201 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 CHPF2-204ENST00000495645 2709 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 SYS1-203ENST00000414310 795 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 FO393415.3-201ENST00000456424 375 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 AC108718.1-201ENST00000482382 554 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 CARD18-202ENST00000530950 652 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 AC133919.2-202ENST00000563515 416 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 ALDH3A1-202ENST00000395555 1495 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 LMO3-212ENST00000535535 1488 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 KIAA0895L-201ENST00000290881 3550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 EP400NL-206ENST00000446190 3697 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 GGACT-201ENST00000376250 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 PHYHIP-202ENST00000454243 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 MBD4-201ENST00000249910 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 CDC25B-205ENST00000439880 3096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 MLXIPL-201ENST00000313375 3278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
LAPTM4AQ15012 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
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