Protein–RNA interactions for Protein: Q14839

CHD4, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD4Q14839 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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CHD4Q14839 FSD2-202ENST00000541889 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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CHD4Q14839 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 AC093627.2-201ENST00000497017 568 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
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CHD4Q14839 AL450487.2-201ENST00000615934 407 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
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CHD4Q14839 HNF1B-207ENST00000621123 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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CHD4Q14839 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
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CHD4Q14839 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 KCNK16-204ENST00000437525 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
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CHD4Q14839 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
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CHD4Q14839 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 HLA-DRB5-201ENST00000374975 1260 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
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CHD4Q14839 LINC00313-207ENST00000451543 413 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
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CHD4Q14839 AC092756.1-201ENST00000560248 448 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 AC010632.2-201ENST00000588369 1224 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 LINC00923-205ENST00000615399 932 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 LINC01669-201ENST00000623161 413 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CHD4Q14839 AP001184.1-201ENST00000637936 376 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
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