Protein–RNA interactions for Protein: Q13813

SPTAN1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTAN1Q13813 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 GPN3-201ENST00000228827 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 PCDH10-203ENST00000618019 4574 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 NFYA-202ENST00000353205 1660 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 TSPY25P-201ENST00000429463 745 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 EVX1-AS-203ENST00000519218 554 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 AC051619.5-201ENST00000559003 736 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 KRT17P4-203ENST00000579355 621 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 AL353997.6-201ENST00000583394 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 MIR4472-1-201ENST00000584349 80 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 AP005131.2-201ENST00000589045 487 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 LINC01224-201ENST00000593573 798 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 TFE3-201ENST00000315869 3415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 PMF1-202ENST00000368277 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 CDKN2C-202ENST00000371761 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 DIO1-203ENST00000388876 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 EEF1B2-203ENST00000392222 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 POLR3H-204ENST00000407461 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 HIST2H2BA-201ENST00000412169 381 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 DIO1-204ENST00000524406 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 DIO1-213ENST00000532493 406 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 PRB3-202ENST00000538488 1283 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 AL355916.2-201ENST00000556543 593 ntTSL 4 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 LINC01569-203ENST00000573268 694 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 RN7SL470P-201ENST00000583069 259 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 AC103810.10-201ENST00000606504 343 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 TMPRSS3-202ENST00000398397 1342 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 ENPP7P8-202ENST00000527856 1345 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 PSTPIP1-207ENST00000559295 1349 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
SPTAN1Q13813 C20orf96-202ENST00000382369 1420 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 PPP1R1B-202ENST00000394265 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 HNRNPA1P58-201ENST00000403629 610 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 FAM90A21P-201ENST00000510875 1396 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 FAM90A15P-201ENST00000514465 1395 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 FAM90A6P-201ENST00000515148 1394 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 FAM90A16P-201ENST00000526662 1395 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 FAM90A9P-201ENST00000527940 1395 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 FAM90A5P-201ENST00000528738 1395 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 FAM90A14P-201ENST00000530386 1395 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 FAM90A13P-201ENST00000534703 1395 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
SPTAN1Q13813 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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