Protein–RNA interactions for Protein: Q13797

ITGA9, Integrin alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA9Q13797 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 LINC00351-201ENST00000424926 911 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 AC073133.1-201ENST00000426187 432 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 AC090825.1-203ENST00000558188 582 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 AC009133.1-201ENST00000569981 2449 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 CAPN1-224ENST00000533129 2792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 MAEL-202ENST00000367872 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 CEP170B-204ENST00000556508 6683 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ITGA9Q13797 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 ADAMTS2-201ENST00000251582 6754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 NCOR2-203ENST00000404621 8520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 SYP-201ENST00000263233 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 PMPCB-201ENST00000249269 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 AL138799.1-201ENST00000448213 1675 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 ANOS1-201ENST00000262648 6314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 IMPACT-201ENST00000284202 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA9Q13797 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms