Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
APOFQ13790 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
APOFQ13790 PPP1R14B-203ENST00000542235 920 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
APOFQ13790 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
APOFQ13790 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
APOFQ13790 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC14.03□□□□□ -0.16
APOFQ13790 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC14.03□□□□□ -0.16
APOFQ13790 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
APOFQ13790 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
APOFQ13790 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
APOFQ13790 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
APOFQ13790 KCNMA1-262ENST00000639489 4302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
APOFQ13790 LSMEM2-201ENST00000316436 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
APOFQ13790 NR1H3-203ENST00000405853 1480 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
APOFQ13790 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
APOFQ13790 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
APOFQ13790 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
APOFQ13790 TNFRSF11A-202ENST00000586569 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
APOFQ13790 POLR1D-207ENST00000621089 1606 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
APOFQ13790 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
APOFQ13790 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
APOFQ13790 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
APOFQ13790 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
APOFQ13790 LAP3-210ENST00000606142 1876 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
APOFQ13790 PITX2-205ENST00000394598 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
APOFQ13790 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
APOFQ13790 MYOM3-201ENST00000338909 2693 ntTSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
APOFQ13790 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
APOFQ13790 PCDHGB7-202ENST00000612073 2785 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.03□□□□□ -0.16
APOFQ13790 VWA8-201ENST00000281496 3475 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
APOFQ13790 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
APOFQ13790 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
APOFQ13790 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
APOFQ13790 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
APOFQ13790 TICAM1-201ENST00000248244 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
APOFQ13790 LINC01341-202ENST00000421003 2600 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
APOFQ13790 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
APOFQ13790 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
APOFQ13790 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
APOFQ13790 AMT-201ENST00000273588 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
APOFQ13790 MPP2-214ENST00000523501 2121 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
APOFQ13790 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
APOFQ13790 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
APOFQ13790 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
APOFQ13790 DUS2-201ENST00000358896 1933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
APOFQ13790 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
APOFQ13790 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
APOFQ13790 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
APOFQ13790 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
APOFQ13790 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
APOFQ13790 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
APOFQ13790 FAM167A-201ENST00000284486 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
APOFQ13790 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
APOFQ13790 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
APOFQ13790 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
APOFQ13790 AC099552.3-201ENST00000454149 367 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
APOFQ13790 AKR1A1-204ENST00000471651 1018 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
APOFQ13790 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
APOFQ13790 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
APOFQ13790 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
APOFQ13790 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
APOFQ13790 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
APOFQ13790 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
APOFQ13790 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
APOFQ13790 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
APOFQ13790 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
APOFQ13790 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC14.02□□□□□ -0.17
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APOFQ13790 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
APOFQ13790 FAAP100-201ENST00000327787 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
APOFQ13790 TSN-212ENST00000536142 3328 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
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APOFQ13790 ASAP3-202ENST00000437606 2865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.17
APOFQ13790 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
APOFQ13790 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
APOFQ13790 LGALSL-201ENST00000238875 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
APOFQ13790 CCDC126-202ENST00000409765 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
APOFQ13790 STK17B-201ENST00000263955 5287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
APOFQ13790 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
APOFQ13790 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
APOFQ13790 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
APOFQ13790 BEGAIN-212ENST00000637716 3259 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
APOFQ13790 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
APOFQ13790 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
APOFQ13790 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
APOFQ13790 HECTD3-202ENST00000372172 3610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
APOFQ13790 FAM219B-201ENST00000357635 3550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
APOFQ13790 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
APOFQ13790 ARHGEF4-217ENST00000611048 3486 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
APOFQ13790 ACIN1-202ENST00000338631 2445 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
APOFQ13790 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
APOFQ13790 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
APOFQ13790 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
APOFQ13790 AC012617.1-204ENST00000586340 2305 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
APOFQ13790 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
APOFQ13790 JPH3-201ENST00000284262 3985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
APOFQ13790 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
APOFQ13790 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
APOFQ13790 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
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