Protein–RNA interactions for Protein: Q13740

ALCAM, CD166 antigen, humanhuman

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Length 583 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALCAMQ13740 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 MXI1-205ENST00000393134 889 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 AC106820.3-201ENST00000561653 397 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 AC004637.1-201ENST00000586675 482 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 ANGPTL8-203ENST00000591200 504 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 ANGPTL8-204ENST00000616433 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 ERO1B-202ENST00000354619 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 ROBO3-201ENST00000397801 4569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 ROBO3-220ENST00000538940 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
ALCAMQ13740 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 SELENOS-201ENST00000398226 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 SH3KBP1-201ENST00000379697 1944 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 ARNT2-209ENST00000622346 2932 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 FAM8A4P-201ENST00000435433 1213 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 DERL3-208ENST00000476077 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 STX1A-201ENST00000222812 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 STX1A-204ENST00000395156 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 GTF2IRD1-203ENST00000455841 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 JKAMP-207ENST00000554271 2137 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 AGAP4-208ENST00000618171 2387 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 RCSD1-206ENST00000537350 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 TMCO5B-204ENST00000529696 1568 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 CRIP1-202ENST00000392531 485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 PEX13-202ENST00000401576 1108 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ALCAMQ13740 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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