Protein–RNA interactions for Protein: Q13634

CDH18, Cadherin-18, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH18Q13634 AC120498.3-201ENST00000568884 542 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 FBXL12-208ENST00000589626 1920 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 PAQR6-214ENST00000613336 1599 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 CMTM3-203ENST00000460097 1797 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 MEF2D-201ENST00000348159 5965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 SPATA6-204ENST00000396199 4964 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 TSHR-202ENST00000342443 1281 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 ITPA-201ENST00000380113 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 ITPA-202ENST00000399838 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 DRGX-202ENST00000434016 955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 VGLL4-214ENST00000451674 938 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 C2orf69P2-201ENST00000562032 1123 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 PPY2P-201ENST00000582808 702 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 PPY2P-202ENST00000583761 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 SIGLEC7-202ENST00000317643 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 CDKN2B-AS1-208ENST00000580576 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 RHOT1-203ENST00000358365 3297 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 PCDHA9-202ENST00000532602 6293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 IRF2BP2-201ENST00000366609 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
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CDH18Q13634 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 LHFPL4-201ENST00000287585 4880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 PFN1P12-201ENST00000455938 534 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 TMEM14B-210ENST00000473276 730 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 SNHG9-201ENST00000531523 275 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 AC136428.1-201ENST00000569103 349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 AP002360.2-202ENST00000572035 738 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 ELOF1-208ENST00000591912 899 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CDH18Q13634 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
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