Protein–RNA interactions for Protein: Q13608

PEX6, Peroxisome assembly factor 2, humanhuman

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Length 980 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PEX6Q13608 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
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PEX6Q13608 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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PEX6Q13608 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 PUS1-202ENST00000376649 4094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 TIGD4-201ENST00000304337 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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PEX6Q13608 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
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PEX6Q13608 AC120045.2-201ENST00000567334 178 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 AC093813.1-201ENST00000605066 256 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 UBQLN1-202ENST00000376395 4118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
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PEX6Q13608 AL354714.1-201ENST00000356006 2136 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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PEX6Q13608 AC148477.2-201ENST00000537762 3039 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
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PEX6Q13608 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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PEX6Q13608 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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PEX6Q13608 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
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PEX6Q13608 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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PEX6Q13608 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 AC012508.2-201ENST00000567613 1472 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 SMOC2-201ENST00000354536 3150 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 GPKOW-201ENST00000156109 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 GRN-201ENST00000053867 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 PRKAG2-215ENST00000492843 2699 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
PEX6Q13608 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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